Спасскую церковь начали в мае 1824 года, приурочив это событие к победе русских войск над Наполеоном. По замыслу одного из батюшек, новый храм должен был стать близнецом Казанского собора в Санкт-Петербурге. Поскольку постройка велась лишь на пожертвования, строительство растянулось на годы и завершилось лишь в 1845-ом.
Новая церковь была настоящей красавицей и сразу же стала одной из градообразующих архитектурных доминант старой Уфы. Её фасад украшала полукруглая колоннада из 36 колонн, по краям находились колокольни, в одной из которых располагалась часовня, а в другой – сторожка. Это была единственная двуколоколенная церковь в городе и уезде. Всё пространство внутренних стен храма было щедро расписано, прихожан встречал трехъярусный резной иконостас.