Северный вокзал (Nordbahnhof) был открыт в Кёнигсберге на Ганза плац (позже - Адольф Гитлер плац, ныне - площадь Победы) в 1929 году, заменил старые Кранцевский и Земландский вокзалы, располагавшиеся в том же районе.
В ходе боевых действий Второй мировой войны зданию Северного вокзала был нанесен значительный ущерб. Движение поездов было вновь открыто в мае 1964 года.
В послевоенные годы восстановленное здание вокзала стало использоваться в качестве Межрейсового дома моряков, а непосредственно перед железнодорожными путями было построено небольшое одноэтажное здание с кассами и залом ожидания. С 1998 года в бывшем здании вокзала располагается Калининградский деловой центр.