В пещере отыскали множество видов останков животных. В текущий момент в пещере ведутся археологические работы, уже собрали более 50 тысяч разнообразных и очень ценных экспонатов, которые можно будет увидеть в музеях Новосибирска, Бийска, а также в музеях школ сёл Черный Ануй и Солонешное. Рядом с пещерой институтом археологии Сибирского отделения РАМН был организован лагерь археологии. Денисова пещера возвышается над уровнем моря на 670 метров, имеет площадь в 270 метров квадратных и 110 метров длины. Находится в долине реки Ануй, близ Алтайского края и Республики Алтай, в 4 километрах от деревни Черный Ануй и в 40 км от районного центра Солонешное.