Является важным культурно-историческим учреждением города. Музей собирает, сохраняет и экспонирует уникальные археологические находки и артефакты, связанные с историей Крыма и Феодосии — от древних времён до средневековья. В его коллекциях представлены предметы быта, оружие, украшения, керамика и скульптуры, раскрывающие культурное разнообразие региона и его роль как пересечённого торгового и культурного пути.