Ботанический сад ЧелГУ — научный центр, специализирующийся на интродукции растений местной флоры и экзотических видов. Решение о его создании было принято 29 июня 1999 года, после чего началось формирование коллекций закрытого и открытого грунта. В саду собрано около 2500 таксонов живых растений, включая тропические и субтропические виды, а также редкие и исчезающие растения, занесённые в Красную книгу Челябинской области и Российской Федерации. Здесь также представлен гербарий с более чем 25 тысячами образцов, имеющий международный акроним CSUH, и ботаническая библиотека. С 2005 года ведётся создание и пополнение семенного фонда, а с 2008 года издаётся перечень семян для обмена с другими ботаническими учреждениями. В 2015 году был заложен Сад Истории Уральской селекции из 70 плодовых деревьев. Ботанический сад ЧелГУ играет важную роль в сохранении биоразнообразия и развитии ботанических исследований региона.