Храм в честь Воздвижения Честнаго и Животворящего Креста Господня
В 1620 году царь Михаил Федорович пожаловал 40 рублей на строительство новой монастырской церкви. Возможно, замысел возведения еще одного храма возник после разрушения обители поляками. Теплый Крестовоздвиженский храм построили через пять лет при игумене Серапионе. В нем появился нарядный иконостас, богатая утварь, стены и своды были покрыты росписями, выполненными маслом. В 1735 году к нему пристроили придел в честь праведных Симеона Богоприимца и Анны Пророчица. После переименований - в честь Иоакима и Анны, а затем в честь святителя Арсения Тверского - в 1818 году его реконструировали на пожертвования романовской помещицы Е.И. Лотыревой и освятили в честь Толгской иконы Божией Матери. В 1838 году при архиепископе Аврааме в храме растесали окна и подняли своды, чтобы в нем было больше света и воздуха. В 1867 году в алтарной части устроили придел во имя святого благоверного князя Александра Невского, небесного покровителя императора Александра Николаевича. Это сделали в память о чудесном спасении царской семьи во время крушения поезда 4 апреля 1866 года.
С западной стороны к церкви пристроили двухэтажный корпус с отдельным входом, который служил палатами для епархиальных архиереев, а с конца XIX века его стали занимать наместники.
В 1878 году при архимандрите Павле (Глебове) храм благоустроили. Вместо четырех старинных печей, от которых шла копоть, в подвале поставили одну духовую, чтобы тепло распределялось равномерно по всей площади. Как и в соборе, здесь положили чугунные полы. Богатый иконостас переколотили.