Депозитарий – хранилище музейных фондов, которое не представляет доступа посетителям. Однако, фонды Великоустюгского музея-заповедника являются редким исключением: большие площади коллекций, хранимых здесь, доступны для посетителей. Это стало возможным в 2007 г., когда здание бывшего кинотеатра было переоборудовано под огромное музейное хранилище. Одна из главных коллекций, хранимых здесь, – уникальная коллекция изразцов, в которой насчитывается более 3500 удивительных экспонатов. В основном это печные изразцы, которые прекрасно иллюстрируют историю бытования изразцовых печей в Великом Устюге. Помимо этого, здесь представлены расписные прялки, предметы мебели, воссозданы интерьеры жилых домов XIX в. Особое место отведено шемогодской резьбе по бересте, коллекциям фарфора и фаянса и множеству других интереснейших и уникальных предметов искусства.