Колокольня Спасо-Преображенского собора — архитектурная доминанта ансамбля, построенная в 1730 году на месте прежней деревянной звонницы. Сооружение выполнено в ярусном стиле: массивный нижний четверик переходит в арочные проёмы звона, над которыми возвышаются два восьмерика и чашевидная глава. Архитекторы стремились облегчить верхние ярусы, чтобы высокая колокольня не затмевала собор.
Колокольня связана с трагическими событиями 1591 года: именно с неё был дан набат, оповестивший жителей о гибели царевича Димитрия. Впоследствии набатный колокол был подвергнут символической казни и отправлен в ссылку, а спустя столетия возвращён в город.
В XIX веке на колокольне работали часы, а в 1980-х годах были установлены новые, изготовленные на местном часовом заводе, и восстановлен набор колоколов. Колокольня остаётся важным памятником архитектуры и истории, символизируя не только религиозное, но и гражданское значение для города.