Строительство железнодорожной станции в селе Убинском началось в 1896 году в рамках возведения Транссибирской магистрали. К 1903 году строительство магистрали было завершено. В этот же период был возведён железнодорожный вокзал, здание которого сохранилось до наших дней в своём первоначальном внешнем облике. Внутренние помещения вокзала со временем претерпели изменения в результате проведённых ремонтов.