Сама школа была учреждена в 1954 г. Однако строительство началось намного позже. По каким причинам и где размещалась школа до получения здания, не известно. Школа открылась только в 1956 г. Построена она для детей работников судоремонтного завода и речного порта. Рассчитана была она на 880 учеников, однако первыми учениками стали всего 230 детей.
С 2002 г. школа считается памятником историко-культурного наследия города, носит гордое имя Советского инженера-строителя, энергетика, генерала-майора, организатора военно-морского и промышленного строительства Ивана Васильевича Комзина.