Антипиевская церковь представляет собой типичный одноэтажный зимний храм с маленькой главкой на невысоком барабане. Колокольня церкви, вероятно, была построена раньше основного здания и отличается характерной для XVII века наружной расцветкой. Колокольня выполнена в виде восьмерика, установленного на четырехгранной основе, и украшена вогнутым шатром с тремя рядами слуховых отверстий. Церковь была освящена в честь священномученика Антипия, епископа Пергамского, который считается избавителем от недугов, особенно зубных болезней.
После революции храм был закрыт, а его внутреннее убранство расхищено. В 1959 году была проведена реставрация, в ходе которой восстановлена наружная расцветка колокольни. В 1994 году церковь была передана в пользование неканонической «Российской православной свободной церкви», а в 2009 году возвращена Русской православной церкви. Внешний вид церкви поддерживается с 1960-х годов, когда Суздаль стал туристическим центром.