Михайловская клиническая больница им. Я. В. Виллие была построена в 1865–1873 годах по проекту архитектора К. Я. Соколова на средства, завещанные лейб-медиком Яковом Васильевичем Виллие.
Она создавалась как клиническая больница при Медико-хирургической академии и была передана в её ведение.
В здании разместили церковь, аудитории, лабораторию, дезинфекционную камеру, водопровод, газ и отопление.
На фасаде размещена надпись Labore et scientia, arte et humanitate — «Трудом и знанием, искусством и человечностью».
На территории Михайловской больницы так-же арх. Л. Руска был построен отдельный двухэтажный жилой дом.
Вокруг здания разбит
Боткинский сквер, установлены памятники Я.В. Виллие и С.П. Боткину.