В связи с нехваткой тюремных помещений в 1870 году была разобрана валганговая стена Трубецкого бастиона и на освободившемся месте построено двухэтажное пятиугольное здание тюрьмы. Тюрьма была окончательно закрыта лишь в 1924 году и передана музею, в настоящее время в ней располагается экспозиция, рассказывающая об истории и узниках главной политической тюрьмы России.