Часовня была возведена в память о чудесном избавлении города от холеры. В 1931 году часовня, как и сама Никольская церковь, была закрыта в связи с обнаружением в их стенах различных ценных вещей, замурованных ранее. На долгие годы часовня утратила своё первоначальное назначение.
В 1992 году начались переговоры о возвращении всего комплекса зданий Никольской Единоверческой церкви. Часовня была передана церкви в том же году.