Императорская певческая капелла была создана в 1713 году для подготовки певцов к Придворному хору, основанному Петром I. Хор включал певчих дьяков, существовавших еще со времен Ивана Грозного. Первым руководителем капеллы стал Дмитрий Степанович Бортнянский, известный как создатель жанра русского хорового концерта.
С начала XIX века капелла разместилась на Набережной реки Мойки. В 1880-х годах здание было перестроено по проекту Леонтия Николаевича Бенуа и получило концертный зал с отличной акустикой.
Постепенно капелла расширила свою деятельность, контролируя издание и исполнение русской духовной музыки. Открылись классы по инструментальной подготовке и обучению регентов, руководителей церковных хоров. Среди преподавателей числятся композиторы Михаил Иванович Глинка и Николай Андреевич Римский-Корсаков.
С приходом советской эпохи заведение продолжило свою работу и дожило до наших дней.