С первых дней освоения Васильевского острова, который по плану должен был стать центром северной столицы, селилось много немцев-лютеран, которых Пётр I привлекал на русскую службу. Приход Святого Михаила долго ходатайствовал о создании кирхи и наконец в 1874 г. строительство собора было начато. Собор выполнен в псевдоготическом стиле. Богослужения были возобновлены с 1993 года. В настоящее время в соборе также проходят концерты духовной музыки.