В 1922 году по инициативе заведующего кафедрой морфологии и систематики растений доктора ботаники, профессора А.Г. Генкеля начались работы по созданию ботанического сада Пермского университета. В первый же год был заложен дендрологический питомник, разбиты коллекционные участки и дендрарий, организован сбор семян дикорастущих и культивируемых в саду растений.
В 1988 году Пермский облисполком объявил территорию ботанического сада ПГУ имени А.Г. Генкеля памятником природы местного значения. Помимо этого учебный ботанический сад входит в состав Совета ботанических садов Урала и Поволжья, Совета ботанических садов России, взаимодействует с Международным советом ботанических садов по охране растений.
В настоящее время Учебный ботанический сад им. проф. А.Г. Генкеля Пермского государственного национального исследовательского университета на занимает территорию площадью 1,97 га. Здесь выращивается более 5000 видов растений, представленных более чем 8000 таксонами. Территория зонирована на экспозиционную, производственную и научную зоны. Основными научными направлениями работы являются: интродукция и акклиматизация растений, выведение и отбор новых форм и сортов, наиболее стойких и продуктивных в местных условиях.