Уникальное собрание растений под открытым небом, одна из экспозиций Ботанического сада – «Парк Бонсай», занимает площадь около 1,5 га. Здесь представлены растения районов Западной и Восточной Сибири, Дальнего Востока, северной Японии и Китая, Европы и Северной Америки. В центре парка расположен небольшой пруд с разноцветными карпами кои.
Бонсаи (карликовые деревья) расставлены по всему парку, они перемежаются с различными инсталляциями из природных материалов: коры, камней, веток и артефактов: старинных утюгов, чугунных горшков и японских фонариков.