В 1906 году в Мерзляковском переулке открылась мужская прогимназия с шестилетним сроком обучения. Архитектор Н. И. Жерихов.
В 1910 году она стала мужской гимназией с 8-летним сроком обучения, получила собственное здание, сохранившееся и поныне. Попечителем и основателем гимназии был Александр Ефимович Флёров.
Владельцы и значимые персоны
Директором гимназии в 1911 году назначен Александр Сергеевич Барков, впоследствии видный ученый-географ, академик. Преподавались русский и иностранные языки, алгебра, геометрия, физика, право и др. В гимназии Флёрова училось много детей из семей московской интеллигенции: ученых, инженеров, врачей, артистов, художников. Учились также дети из семей фабрикантов Коншиных, Ляминых, Морозовых, князей Енгалычевых, начальника московского охранного отделения А. П. Мартынова.