Надпись на мемориальной доске: Название XVI-XVII века. Дано по церкви Трех святителей: Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста (первоначально храм заложен в XIV веке, существующий ныне построен в XVII веке). В 1924 году был переименован в Малый Вузовский переулок. В 1994 году переулку возвращено его историческое название.