Усадьба основана государственным деятелем Михаилом Никитичем Кречетниковым, в начале XIX века им владела Мария Семёновна Бахметьева, а в 1826 году имение перешло к ее племяннику Сергею Васильевичу Шереметьеву. С этого времени Шереметьевы стали считать Михайловское своим родовым гнездом.
В 1834 году усадьба была продана Алексею Ивановичу Мусину-Пушкину. В 1870 году граф Сергей Дмитриевич Шереметьев выкупил имение.
В настоящее время на территории бывшей усадьбы располагается санаторий для лечения заболеваний сердечно-сосудистой системы.