Четырнадцатое московское депо было открыто 1 марта 1991 года вместе с Тимирязевским радиусом метрополитена. Депо «Владыкино» совместно с депо «Варшавское» обслуживает Серпуховско-Тимирязевскую линию метро. В 2003 году депо «Владыкино» стало обладать самым большим количеством пассажирских составов — их количество составило 47 штук.