1 сентября 1994 года специалисты гамбургской фирмы «Рудольф фон Беккерат» завершили строительство единственного в Краснодаре органа.
Зал является уникальной площадкой, где проходят концерты симфонической, камерной, органной и хоровой музыки, вокальные вечера и дневные программы для детей и юношества.
Это домашняя сцена для двух оркестров Краснодарского муниципального творческого объединения «Премьера» - Кубанского симфонического оркестра и камерного «Премьер-оркестра», бессменного хранителя органа, заслуженного артиста Кубани Михаила Павалия, Екатерины Рыбальской (фортепиано) и др.
Ежегодно МКЗ проводит фестиваль искусств «Екатеринодарские музыкальные вечера» и Международный фестиваль органной музыки, принимает Международный музыкальный фестиваль «Времена года».
В 2018 г. Муниципальный концертный зал был реконструирован: была улучшена его акустика, гармонизирующая звучание органа и оркестра, обновлены интерьеры партера на 344 места, балкона на 80 мест и холла второго этажа, установлены новые кресла.