Церковь Смоленской иконы Божией Матери является частью Богоявленско-Анастасиина монастыря. Она была освящена в честь чудотворной иконы Смоленской Божией Матери. Храм был возведен в период с 1559 по 1565 годы и считается самым древним из сохранившихся церковных строений обители. В 1864 году здание было расширено, к нему пристроили церковь из красного кирпича, которая выделялась на фоне белого собора. Церковь имеет значительное историческое значение, так как в ее стенах находятся святые мощи Никиты Костромского, основателя Богоявленского монастыря, почитаемого в лике святых. В 1990 году, после возвращения монастырских зданий Русской православной церкви, стены и потолочные своды храма были украшены полихромными фресками. Список иконы Смоленской Божией Матери в виде фрески был создан на стене юго-западной башни монастырской стены в 1672 году иконописцами артели Гурия Никитина.