Улица названа в честь выдающегося советского учёного в области механики, первого доктора физико-математических наук из татар Хамида Музафаровича Муштари (1900-1981). Существовавшие на этом месте ранее улицы Комиссариатская и Новокомиссариатская в 1923 году были объединены в улицу Комлева. Новая улица получила название в честь А.П. Комлева - участника Гражданской войны, погибшего при обороне Казани. В 1996 году улица Комлева была переименована в улицу Муштари.