По проекту архитектора А.И. Песке построены главный корпус, два флигеля на углах Сибирского тракта (ныне ул. Ершова) с улицами Академической (ныне Вишневского) и Госпитальной (ныне Чехова) и металлическая ограда на кирпичных столбах вдоль Сибирского тракта. В 1887-1889 гг. главный корпус и флигеля расширены. Главный фасад увеличен с 20 до 40 окон, вглубь двора построены два крыла и здание из прямоугольного стало П-образным. Фасады флигелей по Сибирскому тракту остались прежними, а боковые увеличены с 4 до 16 окон. В 1930-е г. флигель на углу ул. Ершова и Чехова надстроен двумя этажами.
Казанская духовная академия, открытая в 1842 г. - высшее учебное заведение, принадлежавшее Русской Православной церкви, одна из четырех в России. Была предназначена для подготовки преподавателей духовных учебных заведений, ее студентами становились лучшие выпускники духовных семинарий. В Казанской духовной академии работали многие видные ученые - богословы, философы, историки, языковеды, филологи, востоковеды и др., сформировались многие научные школы. Более 50 выпускников Казанской духовной академии стали архиереями и сыграли важную роль в истории Русской Православной церкви.
Главный трехэтажный корпус размещается в саду, с отступом от линии улицы, выходит северным фасадом на ул. Н. Ершова и отделяется от нее металлической оградой по кирпичным столбам и цоколю. С восточной и западной сторон от него по красной линии застройки находятся два флигеля, выстроенные в 1849 г. под квартиры наставников.