История музея началась в 60-х годах ХХ в. с крохотного уголка в Еткульской средней школе. Основателем музейного собрания был Владимир Иванович Сосенков.
Сегодня музей – это комплекс из двух зданий, где разместились историко-краеведческие экспозиции «Тыл и фронт едины», «Откуда есть земля Эткульская», «Естественно-географический зал». Сотрудники постоянно пополняют их новыми экспонатами, тем самым обогащая и расширяя представленный материал. Здесь же располагается фондохранение, где обрабатывается вновь поступивший материал, оформляются коллекции.
Второе здание – это выставочно-административная часть музея. Здесь организуют выставки из собственного фонда и фондов других музеев, в первую очередь Государственного исторического музея Южного Урала.