Духовная семинария возведена в 1826–1828 гг. по проекту архитекторов Трофимова и Кудинова. Ныне в здании размещается Министерство промышленности и инновационной политики Республики Башкортостан.
Старое название холма, которым начинается улица Карла Маркса, – Семинарская гора, по построенному здесь в 1828 г. зданию Духовной семинарии. При советской власти это название основательно подзабылось, но археологами оно используется и сегодня для обозначения погребения VII в. с богатым инвентарем – во время раскопок на этом холме из земли было извлечено много бронзовых, серебряных, позолоченных и золотых украшений (пряжки, фибулы, серьги, перстни, браслеты, шейные гривны, медальоны и т. д.), а также вооружения – мечей, ножей и металлических накладок луков.
Здание Духовной семинарии – памятник архитектуры XIX в., один из лучших образцов архитектуры классицизма в Уфе.