Сравнительно небольшое двухэтажное здание с подвалом имеет в плане Т-образную форму с полукруглым выступом (полуротондой) с северо-восточной стороны. Здесь находится круглый двухсветный лекционный зал, перекрытый куполом. С фасада зал украшен полукруглой ионической колоннадой на высоком цоколе. Зал освещается только со стороны главного фасада, удачно приспособлен для занятий; сиденья расположены амфитеатром. В оформлении фасада здания использованы очень простые архитектурные средства, мастерски увязанные с его функциональным назначением. В наши дни Анатомический театр используется по прямому назначению - здесь занимаются студенты КГМУ. В этом здании с 1868 по 1871 гг. работал выдающийся анатом профессор Лесгафт Петр Францевич.
В этом здании с 1905 по 1915 гг. работал действительный член АМН СССР профессор Тонков Владимир Николаевич.
В этом здании с 1924 по 1944 гг. работал действительный член АМН СССР профессор Терновский Василий Николаевич.