Комендантский дом расположен над главными воротами Нарын-кала-капы. Построен он в XVIII веке Фатали-ханом. Сначала здесь находился Диван-хана — ханская канцелярия. После перехода Дербента под юрисдикцию Российской империи в здании устроили комендатуру. Сегодня в бывшей канцелярии – музей, в котором собрана интересная коллекция древних вещей, найденных при раскопках. Некоторым экспонатам более пятнадцати веков.