Предтеченский собор был не просто крепостной церковью, а полноправным духовным центром острова. Здесь хранилась святыня — икона Казанской Божьей Матери. Во время захвата крепости шведами икона была спасена: по преданию, служители храма тайно замуровали её в одну из стен.
При шведской власти собору придали иное назначение — здание превратили в лютеранскую кирху. Но уже в 1702 году, после возвращения острова под контроль российских войск во главе с Петром I, собор вновь стал православным. Икона была найдена, и Предтеченский собор снова начал привлекать паломников. Упоминания о ней исчезают лишь в 1930-х годах — тогда же теряется и её след.
В годы Великой Отечественной войны, лишённый богослужебной функции, собор стал символом несгибаемого духа обороны. На его шпиле ежедневно поднимали красное знамя — знак того, что крепость стоит. Сегодня эта традиция возрождена: в День Победы знамя вновь развевается над руинами Предтеченского собора.