Трубецкой бастион был построен как деревоземляное сооружение в 1703 году под руководством князя Ю.Ю. Трубецкого, что и дало бастиону название; в 1709 году был первым из всех бастионов Петропавловской крепости перестроен в камне. Сигнальная пушка для полуденного выстрела, позже перенесённая на Нарышкин бастион, первоначально располагалась на Трубецком бастионе. Первые арестантские помещения располагались также в Трубецком бастионе, первым узником стал царевич Алексей Петрович.