Церковь была освящена во имя святого Пантелеймона, в праздник которого (27 июля по старому стилю) российский флот нанёс поражения шведскому флоту при Гангуте (1714 г.) и Гренгаме (1720 г.).
В 1914 году по инициативе Императорского Российского военно-исторического общества на фасаде установлены мемориальные доски с перечнем полков, сражавшихся при Гангуте и Гренгаме. В 1936 году храм был закрыт, с 1980 года в здании церкви размещалась выставка «Гангутский мемориал»; богослужения возобновлены в 1994 году.