В 1878 г. отец Алексея Андреевича Истомина построил небольшой дом у моста через Засорный овраг. Наследовав дом, Алексей Истомин приобрел и землю на склонах оврага Засора, где 5 мая 1912 г. заложил свой частный ботанический сад, в организацию которого он вложил 80 000 рублей. Проект создавался петербургскими художниками и садоводами-декораторами. Здесь были посажены местные и редкие для Вятки породы деревьев и кустарников, построена оранжерея для цветов. С приходом советской власти всё имущество отставного подполковника Алексея Истомина было конфисковано, в том числе и сад. Сам Истомин уехал в слободу Кукарку, где преподавал ботанику в школе. Впоследствии Ботанический сад объявили собственностью города – лабораторией губернского отдела народного образования, а в 1923 году сад был передан Вятскому педагогическому институту (позже ВятГГУ). После слияния вузов города в 2015 г. сад перешёл в ведение ВятГУ. В 2016-2017 гг. проведена его реконструкция.