Он был основан в 1624 году при покровительстве царя Михаила Федоровича Романова.
Монастырь строили на протяжении нескольких веков, он несколько раз горел и существовал исключительно на пожертвования прихожан.
На рубеже XVII — XVIII столетий на месте старой деревянной церкви была построена каменная Спасо-Преображенская церковь в стиле русского «узорочья». Позднее появились новые постройки, в том числе колокольня с двенадцатью колоколами. Среди них — особо древний, с изображением Распятия, отлитый в 1627 году.
Монастырь закрыли в годы большевистских гонений, внутреннее пространство храмов приспособили под жилые помещения. По рассказам жильцов, они нередко находили церковную утварь и даже вход в подземелье. Как утверждала тогда молва, между женским и мужским монастырями Вятки существовал тайный подземный ход.
В 1900-е годы территорию монастыря вернули церкви. В обители находятся мощи священноисповедника Виктора, епископа Вятского и Глазовского.